ニンジャム博士
ニンジャム研究所所長。「一億総忍者化」を目指し、研究開発に勤しむ日々。自分の研究成果を他人に盗まれるのではないかと、いつも気にしている。

カラクサ
男忍者。いろいろ不明。彼の実態は、これからの研究観察によって明らかになるだろう。

アマクサ
女忍者。いわゆるクノイチ。彼女の実態は、これからの研究観察によって明らかになるだろう。

パラクサ
研究員。カラクサ、アマクサを観察し記録するのが主な仕事。観察記録をわざわざアニメ化している。

コロクサ
研究員。このサイトの作成／運営が主な仕事。頭にソーラーパネルが付いているが、あまり外に出ない。

ソメクサ
研究員。一般市民に向けた忍者製品を開発するのが主な仕事。ヒッピーなのでなかなか出勤しない。

マダムニンジャム
ニンジャム博士の妻。日頃はニンジャム博士を尻に敷く。博士の一億総忍者化計画をなぜか漫画に記録し、影で支えている。

イバラギさん
アルバイト。カラクサの宿敵、イバラ一族の末裔。研究所に潜り込んでスパイしているつもりだが、特に実害はない。

ノバラギさん
嘱託社員。本人曰く「イバラギの妹」ということだが、顔から察するにニンジャム博士と同世代と思われる。